Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IQGAP1P46940 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IQGAP1P46940 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IQGAP1P46940 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IQGAP1P46940 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IQGAP1P46940 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
IQGAP1P46940 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IQGAP1P46940 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms