Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms