Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms