Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBRP36941 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBRP36941 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LTBRP36941 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBRP36941 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBRP36941 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms