Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms