Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RORAP35398 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORAP35398 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RORAP35398 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms