Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA4P35212 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms