Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPC1P35052 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPC1P35052 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms