Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCKBRP32239 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms