Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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