Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC13P31276 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms