Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms