Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms