Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MARCKSP29966 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MARCKSP29966 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms