Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRMP28827 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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