Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NMBRP28336 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMBRP28336 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMBRP28336 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMBRP28336 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMBRP28336 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMBRP28336 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMBRP28336 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMBRP28336 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMBRP28336 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMBRP28336 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms