Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms