Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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