Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HRCP23327 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HRCP23327 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HRCP23327 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HRCP23327 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms