Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DESP17661 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DESP17661 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DESP17661 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DESP17661 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DESP17661 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DESP17661 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DESP17661 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DESP17661 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DESP17661 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DESP17661 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DESP17661 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DESP17661 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DESP17661 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DESP17661 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DESP17661 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms