Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT10P13645 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT10P13645 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT10P13645 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms