Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD8P13378 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms