Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI3P10071 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI3P10071 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI3P10071 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI3P10071 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI3P10071 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI3P10071 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI3P10071 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI3P10071 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI3P10071 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI3P10071 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI3P10071 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI3P10071 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI3P10071 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI3P10071 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI3P10071 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI3P10071 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI3P10071 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI3P10071 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI3P10071 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI3P10071 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI3P10071 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI3P10071 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI3P10071 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI3P10071 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI3P10071 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI3P10071 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI3P10071 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI3P10071 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI3P10071 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GLI3P10071 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI3P10071 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms