Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPBP07199 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CENPBP07199 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CENPBP07199 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPBP07199 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms