Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFP01375 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFP01375 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFP01375 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms