Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNC1O60486 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms