Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUX1O43812 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX1O43812 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX1O43812 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX1O43812 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX1O43812 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX1O43812 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX1O43812 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX1O43812 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX1O43812 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX1O43812 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX1O43812 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUX1O43812 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUX1O43812 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX1O43812 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms