Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COCHO43405 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COCHO43405 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms