Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBDO15205 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBDO15205 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms