Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNMO15061 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNMO15061 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNMO15061 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms