Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNJ2O15056 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms