Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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