Protein–RNA interactions for Protein: A6NF01

POM121B, Putative nuclear envelope pore membrane protein POM 121B, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POM121BA6NF01 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POM121BA6NF01 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms