Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PIAS3Q9Y6X2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIAS3Q9Y6X2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms