Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRAF6Q9Y4K3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRAF6Q9Y4K3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRAF6Q9Y4K3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRAF6Q9Y4K3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRAF6Q9Y4K3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRAF6Q9Y4K3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRAF6Q9Y4K3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRAF6Q9Y4K3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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TRAF6Q9Y4K3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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TRAF6Q9Y4K3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF6Q9Y4K3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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