Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNA3Q9UI47 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms