Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms