Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX3Q9UBR4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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