Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms