Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms