Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms