Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms