Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO28Q9NVF7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms