Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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FANCFQ9NPI8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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FANCFQ9NPI8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FANCFQ9NPI8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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