Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms