Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPV4Q9HBA0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPV4Q9HBA0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms