Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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FOXQ1Q9C009 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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FOXQ1Q9C009 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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FOXQ1Q9C009 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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