Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP3Q9BZ76 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms