Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIFKQ9BYG3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms