Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BBS2Q9BXC9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BBS2Q9BXC9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms